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März 24 2020
in Medizin

Ursprünge des Coronavirus. Genomanalyse: Es ist die "Chimäre" zweier Viren

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Ursprünge des Coronavirus. Genomanalyse: Es ist die "Chimäre" zweier Viren
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Gianluca Ricciodi Gianluca Riccio
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Tags: Coronavirus

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Ein großer Schub bei der Erforschung von Arzneimitteln und Impfstoffen kann durch die Beantwortung einiger einfacher Fragen zu den Ursprüngen des Coronavirus erzielt werden, die noch auf dem Spiel stehen. In welcher Tierart manifestierte sich das Coronavirus erstmals COVID-19? Eine Fledermaus, ein Pangolin oder eine andere wilde Art? Woher kommt das? Aus einer Höhle (oder einem Wald) in der chinesischen Provinz Hubei oder anderswo?

Im Dezember 201927 der ersten 41 Personen, die ins Krankenhaus eingeliefert wurden (66%), passierten einen Markt im Herzen der Stadt Wuhan in der Provinz Hubei. Aber nach einem  Studie im Wuhan Krankenhaus durchgeführt und in Lancet veröffentlicht Der erste identifizierte menschliche Fall hat diesen Markt nicht besucht.

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Eine Schätzung der molekularen Datierung basierend auf genomischen SARS-CoV-2-Sequenzen  Sein Ursprung geht auf den November zurück. Und das wirft Fragen nach den Ursprüngen des Coronavirus auf, insbesondere nach dem Zusammenhang zwischen dieser COVID-19-Epidemie und Wildtieren.

Genomische Daten

Il SARS-CoV-2-Genom ist  wurde von chinesischen Forschern "schnell" sequenziert. Genomanalyse Vergleiche zeigten, dass SARS-CoV-2 zur Gruppe der gehört Betacoronavirus und das ist sehr nah an SARS-CoV, verantwortlich für eine akute Lungenentzündungsepidemie, die im November 2002 in der chinesischen Provinz Guangdong auftrat und sich 29 auf 2003 Länder ausbreitete. SARS verzeichnete 8.098 Fälle, darunter 774 Todesfälle. Solche Fledermäuse sind bekannt Rhinolophus waren die  Reservoir dieses Virus  und dass ein kleiner Fleischfresser, der Zibet der Palmen (Larvenpaguma), kann es seitdem getan haben Zwischengast zwischen Fledermäusen und den ersten menschlichen Fällen.

Seitdem viele  Betacoronavirus  Sie wurden hauptsächlich bei Fledermäusen, aber auch beim Menschen entdeckt. Zum Beispiel RaTG13, isoliert aus einer Fledermaus der Art Rhinolophus affinis Es wurde in der chinesischen Provinz Yunan gesammelt und kürzlich als SARS-CoV-2 sehr ähnlich beschrieben 96% identische Genomsequenzen .

Diese Ergebnisse zeigen, dass Fledermäuse und insbesondere Arten der Gattung Rhinolophusbilden das Reservoir der SARS-CoV- und SARS-CoV-2-Viren.

Ursprünge des Coronavirus
Rhinolophus affinis

Aber wie definiert man einen Panzer? Ein Reservoir ist eine oder mehrere Tierarten, die für das Virus wenig oder gar nicht anfällig sind, es aber beherbergen. Das Fehlen von Krankheitssymptomen erklärt sich aus der Wirksamkeit des Immunsystems dieser Tiere, die es ihnen ermöglicht, die Virusproliferation zu bekämpfen.

Rekombinationsmechanismus

Die Februar 7 2020 Die Wissenschaft erfuhr später, dass im Pangolin ein Virus entdeckt wurde, das SARS-CoV-2 noch näher kommt. Mit 99% der genomische KonkordanzDer Pangolin galt als wahrscheinlicherer Panzer als Fledermäuse.

Alle entschieden sich also für die Ursprünge des Coronavirus? Noch nicht.

Anschließend eine jüngste Studie und noch in Untersuchung zeigt, dass das aus dem malaysischen Pangolin isolierte Coronavirus-Genom (Manis Javanica) ist weniger wie SARS-Cov-2, mit nur 90% der genomischen Übereinstimmung. Dies würde darauf hinweisen, dass das im Pangolin isolierte Virus nicht für die derzeit wütende COVID-19-Epidemie verantwortlich ist.

Protein S.

Das aus Pangolin isolierte Coronavirus ist jedoch in 99 Aminosäuren, die an der Bindungsdomäne des Angiotensin-II-Rezeptors beteiligt sind, zu 74% ähnlich, wodurch das Virus in menschliche Zellen eindringen kann, um sie zu infizieren. Im Gegensatz dazu wurde das RaTG13-Virus aus der Fledermaus isoliert rinolophus affinis  es ist in diesem speziellen Teil sehr unterschiedlich (nur 77% Ähnlichkeit). In der Praxis kann das aus dem Pangolin isolierte Coronavirus in menschliche Zellen eindringen, während das aus der Fledermaus isolierte rinolophus affinis  es ist nicht.

Darüber hinaus legen diese genomischen Vergleiche nahe, dass das SARS-Cov-2-Virus das Ergebnis einer Rekombination zwischen zwei verschiedenen Viren ist, eines nahe an RaTG13 und das andere näher am Pangolin-Virus. Mit anderen Worten, es wäre eine Chimäre zwischen zwei bereits vorhandenen Viren.

Dieser Rekombinationsmechanismus war  bereits beschrieben  bei Coronaviren, insbesondere um den Ursprung von SARS-CoV zu erklären. Es ist wichtig zu wissen, dass die Rekombination zu einem neuen Virus führt, das möglicherweise eine neue Wirtsspezies infizieren kann.

Damit eine Rekombination stattfinden kann, müssen die beiden unterschiedlichen Viren gleichzeitig denselben Organismus infiziert haben.

Zwei Fragen bleiben nun unbeantwortet: In welchem ​​Organismus trat diese Rekombination auf? (eine Fledermaus, ein Pangolin oder eine andere Art?) Und vor allem, unter welchen Bedingungen fand diese Rekombination statt? 

Die Beantwortung dieser Fragen kann die Identifizierung von Behandlungen und die Herstellung eines Impfstoffs beschleunigen. Ärzte kämpfen weiter, die Wissenschaft sucht weiter.


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Gianluca Riccio, Texter und Journalist - Er wurde 1975 geboren und ist Creative Director einer Werbeagentur. Er ist Mitglied des italienischen Instituts für die Zukunft, der World Future Society und des H +, Network of Italian Transhumanists.

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