Bevor ein Arzt einen Patienten behandeln kann, muss er wissen, was mit ihm los ist, oder?
Es ist nicht so schwierig, wenn Windpocken oder ein verstauchter Knöchel das Problem sind, aber Infektionen können für einen diagnostischen Test viel schwieriger zu erkennen sein. Viruspneumonie und bakterielle Pneumonie verursachen beispielsweise ähnliche Symptome, erfordern jedoch möglicherweise unterschiedliche Behandlungen.
Jeder kennt das Problem: Bei einem diagnostischen Test wird nur nach einem Virus, Bakterium oder einem anderen bestimmten Krankheitserreger in einem bestimmten Probentyp wie Blut oder Urin gesucht.
Die Analyse jedes diagnostischen Tests nimmt Zeit in Anspruch. Wenn die erste Testrunde nicht schlüssig ist, muss ein Arzt möglicherweise einen anderen bestellen. Zusammenfassend: Patienten, die sich dem manchmal invasiven Prozess der Probenentnahme und Verzögerungen bei der Behandlung unterziehen.
Der universelle Diagnosetest
UC San Francisco Wissenschaftler sie behaupten, sich entwickelt zu haben Ein einzelner diagnostischer Test, der nach jeder Art von DNA-Probe nach bekannten Krankheitserregern suchen und Ergebnisse liefern kann in nur sechs Stunden.
Wir haben bereits Tests, die nach dem genetischen Code von Viren oder Bakterien in einer Probe suchen. Vor allem ein Beispiel? Der am häufigsten verwendete diagnostische Test für COVID-19 (RT-PCR-Test genannt) sucht nach der Coronavirus-RNA.
Was Forscher von UC San Francisco entwickelt haben, ist ein diagnostischer Test, der mit der Sequenzierung der gesamten in einer Probe vorhandenen DNA (Mensch, Virus, Bakterien und Pilz) unter Verwendung einer vorhandenen Technik namens bezeichnet wird metagenomische Sequenzierung der nächsten Generation (mNGS).
Anschließend durchsucht ein Softwareprogramm die gesamte DNA nach Übereinstimmungen aus einer Datenbank aller bekannten Krankheitserreger. Es findet eine Übereinstimmung und Sie wissen, welcher Krankheitserreger einen Patienten infiziert hat.
Einfach und revolutionär
Die Vielseitigkeit eines universellen Diagnosetests fällt sofort ins Auge. Ein Arzt kann wählen, welcher Probentyp den Erreger am wahrscheinlichsten beherbergt (z. B. Lungenflüssigkeit für einen Patienten mit Anzeichen einer Lungenentzündung). Er muss sich jedoch nicht mehr um die Verwendung eines Tests kümmern, der für diesen speziellen Probentyp entwickelt wurde.
die Studie
Forscher haben zuvor gezeigt, dass ihre Technik zum Nachweis von RNA-Viren aus verschiedenen Körperflüssigkeiten verwendet werden kann. Für ihre neueste Studie veröffentlicht in Nature Medicinehaben sich entschieden, sich auf einen diagnostischen Test zu konzentrieren, der die DNA von Bakterien und Pilzen identifizieren kann.
Zunächst analysierten die Forscher mit ihrem diagnostischen Test 180 Körperflüssigkeitsproben von 160 Patienten. Diese Proben wurden bereits regelmäßigen diagnostischen Tests mit zwei traditionellen Methoden unterzogen: Kulturtest (Versuch, Mikroben in einer Petrischale zu züchten) und PCR-Tests.
Die Forscher verwendeten zwei verschiedene Technologien, um ihre Sequenzen zu generieren: die Sequenzierung von Nanoporen, die Ergebnisse in nur sechs Stunden liefern kann, und die Illumina-SequenzierungDies kann viele Proben verarbeiten, dauert jedoch mehr als 24 Stunden.
Beide Methoden stimmten bei etwa 75% der bakteriellen Infektionen und 91% der Pilzinfektionen mit den Diagnosen traditioneller Methoden überein.
Diagnosetestentwickler Charles Chiu mit einem Sequenziergerät. Bildnachweis: Elisabeth Fall
Der neue Test kann zunächst verwendet werden, nachdem ein Patient mit anderen Routinemethoden negativ getestet hat. Wenn es über die Distanz effektiv ist, kann der universelle Diagnosetest die meisten der aktuellen ersetzen.